Portalerna är tänkta att användas vid miljöövervakning av sötvattenslevande stormusslor och skyddsvärda träd. Enstaka fynd av musslor kan även fortsatt rapporteras i Artportalens småkrypsportal, medan länsstyrelsernas upprepade mätningar av musslornas tillstånd hamnar i Musselportalen. Av stormusselarterna är flodpärlmussla och tjockskalig målarmussla de mest kända och båda ingår i åtgärdsprogram för bevarande av hotade arter.
Trädportalen är ett resultat av Naturvårdsverkets åtgärdsprogram för särskilt skyddsvärda träd, och ska redovisa resultatet av de länsvisa inventeringarna av träd. I första hand är grova träd, gamla träd och hålträd av intresse.
Portalerna är öppna för allmänheten och intresserade är välkomna att hämta uppgifter och rapportera nya. I portalerna finns funktioner för att söka uppgifter, att visa dem på karta eller satellitbild, samt att exportera data. Syftet med portalerna är att underlätta kommunikationen mellan samhällets olika aktörer, och i förlängningen att uppnå en bättre situation för vattendrag och skyddsvärda träd.