Havssköldpaddor lägger sina ägg på sandstränder som påverkas av infrastrukturprojekt, byggnader, turistverksamhet och sandtäkt. Äggen och de nykläckta ungarna hotas av föroreningar, predation från införda arter som grisar och hundar, och ägginsamling. I Västafrika hotar även skogsavverkningen sköldpaddorna, eftersom deras äggläggningsstränder belamras av stockar.
Juveniler och vuxna sköldpaddor i havet hotas av småskalig husbehovsjakt, genom bifångst i industriellt fiske (både långlinefiske, nät och trålning), de äter upp plastpåsar i tron att det är maneter, och de blir påkörda av båtar. Varje år fångas 40 000 havssköldpaddor som bifångst på långrevar. I en studie av långlinefiske fångades 0,27 sköldpaddor per 1000 krokar. Om de tas loss och släpps, vilket sällan händer, är ändå dödligheten 30 %.
Havssköldpaddor är långlivade och blir könsmogna sent, vilket gör dem känsliga för förhöjd dödlighet. Varje vuxen fortplantningsduglig individ är viktig för populationens överlevnad, och redan en måttlig höjning av dödligheten bland dem orsakar en betydande populationsminskning. De flesta sköldpaddor som fångas är av de största storleksklasserna, som också är de viktigaste för reproduktionen.